Este sistema opera a través de lo que la neurociencia llama la "vía rápida". La información sensorial del entorno (ej. una sombra, un tono de voz fuerte) viaja directamente al tálamo y luego a la amígdala, antes de que llegue a la corteza prefrontal (el hardware del Arquitecto α) para un procesamiento consciente.
Esto significa que el piloto automático del Ego ha tomado una "elección" (una reacción) y ha secuestrado el flujo de β (liberando cortisol y adrenalina) antes de que el Arquitecto α sea siquiera consciente de lo que está sucediendo. Esta es la base neurológica del secuestro amigdalar .
El Ego no es "malo"; es simplemente rápido . Su velocidad es lo que mantuvo vivo al hardware γ en la naturaleza. En el mundo moderno, sin embargo, esta misma velocidad es la fuente de la disonancia. La amígdala no distingue entre la amenaza de un "tigre dientes de sable" (amenaza de aniquilación física) y la amenaza de una "crítica de nuestro jefe" (amenaza de aniquilación social). Para el Ego, ambas son amenazas de disolución del "yo", y reacciona a ambas con el mismo protocolo de supervivencia: lucha, huida o congelación.
Si la amígdala es el "motor" reactivo del Ego, la Red Neuronal por Defecto (RND) (Default Mode Network o DMN) es su "software" narrativo. Descubierta por el neurocientífico Marcus Raichle, la RND es una red de regiones cerebrales (incluyendo partes de la corteza prefrontal medial y el hipocampo) que se activa cuando no estamos enfocados en una tarea externa. ¿Y qué hace esta red? Genera el "yo".